选种、育种龙头企业+基地+专业合作社+农户+政策+市场
全国加盟:15925208098

养殖技术

中国水产科学研究院淡 水中心完成染色体程度青

2021-02-17 14:37作者:同创娱乐

  日前,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心傅洪拓研究员团队与华大海洋研究院石琼研究员团队相助,完成了染色体程度青虾基因组图谱拼装,该项事情是青虾和虾蟹类基因组研究的重要打破。研究功效已于2021年1月18日在线颁发在GigaScience,淡水渔业研究中心金舒博博士等为第一作者,傅洪拓研究员等为通讯作者。

 

  研究团队依托江苏省水产三新工程“基于全基因组测序的青虾种质资源和成果基因挖掘(D2015-16)”等项目标扶助,对青虾举办全基因组测序和拼装。由于青虾基因组约为4.57Gb,属于养殖虾蟹类中已知基因组最大的,同创娱乐app,同时杂合度较高,因此基因组拼装面对诸多坚苦。自2015年起,、研究团队开展了青虾全基因组二代Illumina测序、三代Pacbio测序及Hic测序,测序总量高出1500G。历时5年攻关,最终完成了染色体程度青虾全基因组图谱拼装。拼装的青虾基因组总长4.5G,Scaffold N50为86.8 Mb,BUSCO值到达92.6%;团结HIC文库,组装出49条青虾染色体;全基因组共预测到了44,086个卵白编码基因,个中39,317个基因被成果注释,挖掘性别相关基因21个;通过4dTv阐明发明,青虾在约莫1亿年前经验过一次全基因组复制(WGD)事件;基因组进化阐明昭示青虾与L. vannamei和P. virginalis的配合祖先在约莫3.27亿年前疏散。

 

  青虾是我国重要的淡水养殖虾类,全国年养殖产量高出20万吨,年产值约200亿元,青虾养殖已成为农业增效、农夫增收的重要途径。染色体程度青虾全基因组图谱的完成,可为青虾重要成果基因挖掘、分子育种、性别节制机制等研究提供强有力的配景支持,具有重要的学术代价和财富应用前景。

手机:15925208098     座机:0871-67337705

站点地图

Copyright © 2019 同创娱乐农林产业有限公司 All rights reserved